Alonzo T. Jones fusese întotdeauna interesat de istorie, îndeosebi de istoria antică. Chiar și în tinerețe, pe când servea în armată, își petrecea timpul liber citind cărți despre civilizațiile vechi.
După ce a părăsit armata, a devenit adventist de ziua a șaptea și a început să predice în California. Era și un scriitor talentat. L-a cunoscut pe redactorul revistei „Signs of the Times” și a devenit redactor adjunct. Curând, E. J. Waggoner, fiul lui J. H. Waggoner, a devenit coredactor împreună cu Jones.
Mai târziu, Jones a devenit și redactorul publicației „American Sentinel”. Aceasta avea să poarte apoi numele „Sentinel of Liberty”, iar astăzi este cunoscută simplu ca „Liberty”.
În anii care au precedat renumita Conferință de la Minneapolis din 1888, Jones studia, asemenea celor doi Waggoner, și subiectul libertății creștine. Ei au înțeles că în biserică se dezvoltase un accent atât de puternic asupra ascultării, încât mulți oameni ajunseseră să creadă că ascultarea desăvârșită aduce mântuirea. Biserica nu susținuse niciodată oficial această concepție, însă mulți trăiau și predicau ca și când ea ar fi fost adevărată.
În 1888, atât Jones, cât și E. J. Waggoner au vorbit despre neprihănirea desăvârșită a lui Hristos și despre faptul că mântuirea poate fi găsită numai prin El și prin ascultarea Lui desăvârșită. Unii conducători ai bisericii susțineau că o asemenea învățătură îi va face pe oameni să creadă că nu mai trebuie să asculte deloc de Lege. Jones și Waggoner nu afirmau însă așa ceva. Ei spuneau că putem asculta numai prin iubire și libertate și că, odată ce suntem siguri de mântuirea noastră în Hristos, ascultarea va urma în mod firesc.
Departe de a abandona păzirea Sabatului, în anul 1889, la numai un an după conferință, Jones a vorbit înaintea unei subcomisii a Congresului Statelor Unite și a contribuit la respingerea unui proiect de lege care ar fi impus respectarea duminicii în regiunea Washington, D.C.
Dumnezeul libertății desăvârșite, ajută-mă să experimentez libertatea pe care o făgăduiești — libertatea pe care mi-ai oferit-o prin Fiul Tău. Ajută-mă să Te las să transformi această libertate într-o ascultare liberă și iubitoare, iar viața mea, mai mult decât cuvintele mele, să mărturisească despre libertatea desăvârșită aflată în Tine. Amin.